影之刃3的主线剧情共分为六章，每章围绕主角影的江湖历程展开。第一章剑之初作为故事开端，讲述了少年剑客在夜殇大陆的初始冒险，通过与神秘老者的相遇引出世界观核心设定。第二章幽都之门转入被魔力笼罩的都市，新角色花落女剑士的登场为剧情注入更多互动元素。第三章苍之山脉将场景转向危机四伏的山地区域，寒冰女剑士寻找妹妹的支线丰富了叙事层次。
第四章天狼之城呈现被邪恶势力占领的城池攻防战，守护者李雪与主角的合作体现了剧情张力。第五章幻之境作为过渡章节，通过最强剑士幻舞的登场引出高阶战斗体系，同时解密该区域的特殊机制。第六章终结之地作为最终章未完全公开具体内容，但已知包含多线叙事和隐藏结局，需玩家自行探索完整剧情脉络。主线任务贯穿游戏始终，是解锁新区域和功能的必要条件。
主线任务与支线存在联动设计，例如山河之志支线解锁小地图功能，奇戒双生支线开启第二个戒指槽。部分主线关卡需特殊道具才能进入，这些道具往往通过前置支线获取。主线推进过程中随机出现的紫色房间可能触发隐藏任务，建议优先探索以免遗漏关键内容。任务NPC刷新机制独立于难度设定，退出关卡不会消耗额外体力。
角色等级达到45级后，需完成虚空裂缝4层支线才能解锁修罗塔等进阶内容。无尽劫境主线需先通关正道陨落诛邪道人副本，通过36层挑战后与虚空对话交付七朵花。重塑虚空任务涉及六个地图的鬼手踪迹收集，完成后可获得重要资源。主线章节之间存在明确的战力梯度，若遇卡关可返回前章提升装备等级。
主线剧情采用群像剧表现手法，各章节地图开放探索顺序不受限制，但真主线仍保持线性流程。京西十字路口是多个关键任务的交汇点，包括无尽劫境主线起始点。通过雕栏大厅、谢园等场景的剧情选择会影响部分支线走向，但通常不影响主线进程。最终章节的隐藏内容需结合特定心法和装备配置才能完全解锁。
