舰船的选择与搭配是决定战斗胜负的核心因素之一。根据实战表现和CV3000和CVT800是目前最值得推荐的舰船组合。CV3000作为航母，能通过蓝币箱子获取，具备稳定的战场控制能力；CVT800则是护航艇中的佼佼者，兼具对空与对舰输出，能量伤害类型使其在对抗高护甲目标时尤为有效。这两款舰船的协同作战能力极强，适合作为舰队的中坚力量。
对于中前期玩家，ST59和CAS066炮击型是性价比极高的选择。ST59作为前排装甲舰，能有效吸收伤害，但需注意搭配中后排输出舰船以避免火力不足；CAS066炮击型则提供了稳定的远程火力支援，虽无需刻意追求，但若已拥有可优先投入资源培养。KCCPV2.0和AC721载机型适合机动战术，前者凭借轻型巡洋舰的速优势适配快速舰队，后者可作为卫士载机型的平替，兼顾挖矿与战斗需求。
护卫舰中，刺水母级和红宝石级是前期过渡的优质选择，尤其是刺水母级的无人机系统能对大型目标造成可观伤害。驱逐舰方面，斗牛级的脉冲炮塔能量伤害无视护甲，枪骑兵级的攻城舰炮单发伤害突出，两者均能针对特定敌人发挥奇效。斗牛级生存能力较弱，需配合其他前排舰船使用。巡洋舰则推荐卡里斯托和艾奥级，前者鱼雷火力冠绝同级，后者离子炮对护盾薄弱目标压制力极强。
苔原级和卫士级是当前版本最实用的维修舰，苔原级额外搭载的战斗无人机进一步提升了功能性。谷神星支援型则凭借双维修无人机成为中后期奶船首选。若追求极致舰队续航，可尝试乌拉诺斯之矛的改装路线，其6维修无人机的配置能大幅提升持续作战能力。
最后需强调，舰船强度并非绝对，合理搭配才是关键。航母需搭配蜂巢等强力舰载机才能发挥价值，而防空型光锥级或枪骑兵子型号能有效克制敌方空中单位。玩家应根据已有蓝图和战场需求灵活调整编队，避免盲目追求单一舰种。技术值的分配也需优先投入核心舰船，后期再通过洗点功能优化配置。
CV3000、ST59、斗牛级和苔原级构成了当前版本泛用性最强的舰船组合，兼顾输出、防御与支援能力。玩家可围绕这些舰船构建基础舰队，再逐步扩充其他功能性舰种以应对复杂战局。
